Loading

RNA Splicing


Ökaryotik hücrelerde, yeni yapılmış mRNA moleküllerinin çoğu, RNA işleme adı verilen bir dizi modifikasyona uğrar. Hücredeki enzimler, bir uçta başlık adı verilen özel bir nükleotid, diğer uçta ise kuyruk adı verilen bir dizi adenin nükleotidleri ekler. Hem başlık hem de kuyruk, mRNA'nın hücrede bozulmasını önlemeye yardımcı olur. mRNA molekülü ayrıca ayrıntılı bir kesme ve yapıştırma prosedürü olan ekleme işlemine tabi tutulur.







Yeni yapılmış mRNA'nın intronlar ("araya giren diziler" için) olarak adlandırılan bölümleri kesilir ve atılır ve eksonlar ("ifade edilen diziler") olarak adlandırılan kalan mRNA bölümleri tutulur ve birbirine bağlanır. Ekleme, spliceosome adı verilen bir RNA ve protein kompleksinin çalışmasıdır. Yalnızca ekleme tamamlandıktan sonra mRNA bir proteine ​​çevrilmeye hazırdır.

Ökaryotik hücrelerdeki genlerin neden intronları vardır? Bir hücre neden dizileri mRNA'ya kopyalamak için enerji harcar, sadece onları atmak için? İşte birkaç olasılık:

Ekleme, hücrelerin, bir genin açıldığı (transkripsiyonun başladığı) andan proteinin bir ribozomdan çıktığı zamana kadar gen ekspresyonunun hızında ince ayar yapmasına izin verebilir. Başka bir deyişle, ekleme, protein oluşum hızının belirlenmesinde düzenleyici bir role sahip olabilir. Prokaryotlar bunu yapmaz - yeni kopyalanan RNA hemen proteine ​​çevrilir. Bir gen birden fazla ekzon içerdiğinde, hücre hangilerini kullanacağını ve hangilerini atacağını seçebilir. Bu, tek bir genin aslında değişken özelliklere sahip proteinlere yol açabileceği anlamına gelir. Eksonlar genellikle, bitmiş proteindeki alanlar, ayrı üç boyutlu bölgeler ile ilişkilidir. Etki alanları genellikle belirli bir işlevle ilişkilendirilir. Örneğin, bir ekson, eklemeden sonra o ekson korunursa, proteinin zarda demirlenmesine neden olan bir alanı kodlayabilir. Ekzonlar arasından seçim yapma yeteneği, insanların sadece 22.000 genleri olmasına rağmen tahminen 100.000 farklı protein üretebilmelerinin bir nedenidir. Bölünmüş genler, hızlı evrimi mümkün kılan genetik çeşitliliği teşvik edebilir. Bir organizmanın DNA'sının bölümleri, organizma ürediğinde tipik olarak yeniden düzenlendiğinden, modüler bir intron ve ekson düzenlemesi, kromozomlar arasında kodlama dizilerinin değiş tokuşunu kolaylaştırır. Sonuç olarak, yavru organizmanın genlerinde yeni ekzon kombinasyonları olabilir. Transkripsiyon ve translasyondan sonra, doğal seleksiyonla test edilmeye hazır, potansiyel olarak yeni yapılara ve fonksiyonlara sahip yeni proteinler görünebilir.

Yorumlar

Yorum Gönder

ΔΔCt Hesaplama

ΔΔCt Hesaplama











ΔΔCt Sonucu:

Bu blogdaki popüler yayınlar

MİTOKONDRİ’NİN GENOMU ve GÖREVLERİ

Resim
 Rabia YALÇIN  - Moleküler Biyoloji ve Genetik,  Haliç Üniversitesi Mitokondri, tüm ökaryot hücrelerde yer alan ve hücrede meydana gelen kimyasal reaksiyonlar için gerekli enerjiyi sağlayan, sitoplazmada bulunan bir organeldir. Mitokondriler oval görünümlü, yaklaşık 1 µM uzunluğa ve 0,5 µM ene sahiptirler. Enerjiyi, hücrenin sitoplazmasındaki besin maddelerinden ve oksijenden sağlamaktadırlar. Oksidatif fosforilasyonun merkezidir. Mitokondri’nin yapısını incelediğimizde çift katlı iç ve dış membranı, zarlar arası boşluk, DNA, matrixler, ribozomlardan ve kristalardan oluşmaktadır. Bir hücre içerisinde yüzlerce, binlerce mitokondri bulunabilir ve şekil, büyüklük olarak farklılık göstermektedir. Birkaç yüz mikron çapında küresel yapıda ya da birkaç mikron çapında ipliksi görünümde olabilmektedirler. Bütün mitokondri’lerin içerisinde 2-10 arasında değişen mitokondriyal DNA bulunmaktadır. Fakat bu değişkenlik türden türe, kişiye, dokuya göre değişmektedir. İnsanlarda 16 kb, bitkilerde ise 5
Devamı

Soy Ağaçları

Resim
  Doğa Bahçeci - Moleküler Biyoloji ve Genetik,  Doğu Akdeniz Üniversitesi, Kıbrıs Tanımı               Soy ağaçları biyolojide belirli semboller ile aile geçmişini anlatan diyagramlardır. Bir soyağacı, aile üyeleri arasındaki ilişkileri gösterir ve bir aile içinde hangi bireylerin belirli genetik patojenik varyantlara, özelliklere ve hastalıklara sahip olduğunu ve ayrıca yaşamsal durumu gösterir. Bir aile içindeki hastalık kalıtım kalıplarını belirlemek için bir soyağacı kullanılabilir [1].               Bir özelliğin kalıtsal olup olmadığını belirlemek için genellikle en az üç nesil soy ağacına dahil edilir. Bu bilgiyi kullanarak, belirli bir bireyin bu özelliğe sahip olma veya çocuklarına aktarma şansını söyleyebiliriz. Bir soyağacına bakıp anlayabilmemiz için soyağacı çizmenin standart yolları vardır [2].   Soy Ağacı İsimlendirmesi Şekil 1: Soy Ağacı Sembolleri [1].   Soy ağaçlarında erkekleri temsil etmek için kareler ve kadınları temsil etmek için daireler
Devamı

JAK-STAT Sinyal Yolağı

Resim
 JAK-STAT sinyal yolu, bir hücredeki proteinler arasındaki bir etkileşimler zinciridir ve bağışıklık, hücre bölünmesi, hücre ölümü ve tümör oluşumu gibi süreçlerde yer alır. Yol, bir hücrenin dışındaki kimyasal sinyallerden hücre çekirdeğine bilgi iletir, bu da transkripsiyon adı verilen bir süreç yoluyla genlerin aktivasyonu ile sonuçlanır. JAK-STAT sinyallemesinin üç anahtar parçası vardır: Janus kinazlar (JAK'ler), sinyal dönüştürücü ve transkripsiyon proteinlerinin (STAT'ler) aktivatörü ve reseptörler (kimyasal sinyalleri bağlayan). Bozulmuş JAK-STAT sinyali, cilt rahatsızlıkları, kanserler ve bağışıklık sistemini etkileyen bozukluklar gibi çeşitli hastalıklara yol açabilir. JAK'ların ve STAT'lerin Yapısı Dört JAK proteini vardır: JAK1, JAK2, JAK3 ve TYK2.[1] JAK'lar bir FERM alanı (yaklaşık 400 kalıntı), SH2 ile ilgili bir alan (yaklaşık 100 kalıntı), bir kinaz alanı (yaklaşık 250 kalıntı) ve bir psödokinaz alanı (yaklaşık 300 kalıntı) içerir. Kinaz alanı, JAK&
Devamı