Loading

PARP2

 Poli (ADP-riboz) polimeraz 2 (PARP2), DNA hasarının onarımı ve genom bütünlüğünün korunmasında önemli rol oynayan bir enzimdir. İnsanlarda PARP2 geni, 14. kromozom üzerinde bulunur ve 66.206 kDa moleküler ağırlığa sahip bir protein üretir. PARP2, PARP1 ile birlikte hücresel poli (ADP-riboz)ilasyonun büyük bir kısmından sorumludur ve bu iki enzim arasında güçlü bir yapısal ve fonksiyonel benzerlik vardır. Her iki enzim de DNA hasarına yanıt olarak aktive olur ve proteinlere ADP-riboz ekleyerek DNA onarım süreçlerini düzenler. Ancak, son yıllarda yapılan çalışmalar, PARP2'nin PARP1'den ayrı spesifik işlevleri olduğunu ortaya koymuştur. PARP2'nin ekspresyonu, merkezi sinir sisteminde, özellikle neokortekste yüksek düzeydedir. Ayrıca, PARP2'nin transkripsiyonu N-MYC tarafından indüklenebilir ve mikroRNA'lar tarafından modüle edilebilir.






PARP2, DNA hasarının tanınması ve onarımı süreçlerinde önemli bir rol oynar. Özellikle, baz eksizyon onarımı (BER) yolunda PARP1 ve XRCC1 ile etkileşime girerek etkin bir DNA onarımını sağlar. Ayrıca, PARP2'nin, histon PARilasyon faktörü 1 (HPF1) ile etkileşime girerek kromatin modifikasyonlarını düzenlediği ve böylece DNA onarım süreçlerine katkıda bulunduğu gösterilmiştir. PARP inhibitörleri, özellikle kanser tedavisinde umut verici ajanlar olarak dikkat çekmektedir. Bu inhibitörler, PARP1 ve PARP2 enzimlerinin NAD+ bağlanma bölgesine bağlanarak onların aktivitesini engeller. Özellikle, niraparib gibi bazı PARP inhibitörleri hem PARP1'i hem de PARP2'yi inhibe eder ve bu da DNA onarım mekanizmalarını bozarak kanser hücrelerinin ölümüne yol açar.



Son yıllarda yapılan yapısal çalışmalar, PARP2'nin DNA'ya bağlanma mekanizmalarını ve aktivasyon süreçlerini daha iyi anlamamıza yardımcı olmuştur. Özellikle, PARP2'nin WGR domaini aracılığıyla DNA'ya bağlandığı ve HPF1 ile etkileşime girerek aktif bölgesini modüle ettiği gösterilmiştir. Bu etkileşimler, PARP2'nin DNA hasarına yanıt olarak nasıl aktive olduğunu ve ADP-ribozilasyon süreçlerini nasıl düzenlediğini anlamak için kritiktir.



PARP2'nin biyolojik işlevleri, sadece DNA onarımı ile sınırlı değildir. Ayrıca, transkripsiyonel düzenleme, hücre döngüsü kontrolü ve apoptoz gibi süreçlerde de rol oynar. Özellikle, PARP2'nin histon modifikasyonları ve kromatin yapısının düzenlenmesi yoluyla gen ekspresyonunu etkilediği bilinmektedir. Bu da onun epigenetik düzenlemede önemli bir oyuncu olduğunu göstermektedir.



Sonuç olarak, PARP2, hücresel fonksiyonların düzenlenmesinde ve genom bütünlüğünün korunmasında kritik bir rol oynayan multifonksiyonel bir enzimdir. Onun yapısal özellikleri, etkileşim partnerleri ve biyolojik işlevleri üzerine yapılan güncel araştırmalar, PARP2'nin hücresel süreçlerdeki karmaşık rolünü daha iyi anlamamıza yardımcı olmaktadır. Bu bilgiler, kanser gibi hastalıkların tedavisinde yeni stratejilerin geliştirilmesine de katkı sağlayabilir.

Yorumlar

Yorum Gönder

ΔΔCt Hesaplama

ΔΔCt Hesaplama











ΔΔCt Sonucu:

Bu blogdaki popüler yayınlar

HİSTOKİMYA ve HİSTOKİMYASAL YÖNTEMLERDE KULLANILAN BOYALAR

Resim
  Zeynep Anaz – Moleküler Biyoloji ve Genetik,  Haliç Üniversitesi HİSTOKİMYA NEDİR? Maddeleri doku ya da hücre içerisinde mikroskop ile inceleme yapmak için görünür bir hale getiren özel bir kimyasal metoda histokimya ismi verilir. Ayrıca histokimya maddeleri doku ve hücre seviyesinde incelemeye yarayan, miktarlarını ve nasıl yerleştiklerini tespit edilmesine yardımcı olan kimyasal yöntemlerin ortak adıdır. Reaktif gruplar, özgün maddeler ve enzim katalizörleri bu amaç nedeniyle kullanılabilir.(Doran, 2005) Histoloji metotlarında takip edilen süreç doku takibi şeklinde isimlendirilir. Dokunun desteklenmesi için gereken sertlikte olan bir katı alana gömmek amacıyla da doku takibi yapılmaktadır. Genellikle histoloji metotu uygulanan dokular cansız şekilde gözlemlenir. Bazı dokular vital boyalar aracılığıyla canlı olarak gözlemlenebilir. Canlı gözlemlenen dokulara kurbağa yavrusunun kuyruğu, mezenteryum ve spermatozoon örnek olarak gösterilebilir. İdeal histokimyasal boyam...
Devamı

Soy Ağaçları

Resim
  Doğa Bahçeci - Moleküler Biyoloji ve Genetik,  Doğu Akdeniz Üniversitesi, Kıbrıs Tanımı               Soy ağaçları biyolojide belirli semboller ile aile geçmişini anlatan diyagramlardır. Bir soyağacı, aile üyeleri arasındaki ilişkileri gösterir ve bir aile içinde hangi bireylerin belirli genetik patojenik varyantlara, özelliklere ve hastalıklara sahip olduğunu ve ayrıca yaşamsal durumu gösterir. Bir aile içindeki hastalık kalıtım kalıplarını belirlemek için bir soyağacı kullanılabilir [1].               Bir özelliğin kalıtsal olup olmadığını belirlemek için genellikle en az üç nesil soy ağacına dahil edilir. Bu bilgiyi kullanarak, belirli bir bireyin bu özelliğe sahip olma veya çocuklarına aktarma şansını söyleyebiliriz. Bir soyağacına bakıp anlayabilmemiz için soyağacı çizmenin standart yolları vardır [2].   Soy Ağacı İsimlendirmesi ...
Devamı

JAK-STAT Sinyal Yolağı

Resim
 JAK-STAT sinyal yolu, bir hücredeki proteinler arasındaki bir etkileşimler zinciridir ve bağışıklık, hücre bölünmesi, hücre ölümü ve tümör oluşumu gibi süreçlerde yer alır. Yol, bir hücrenin dışındaki kimyasal sinyallerden hücre çekirdeğine bilgi iletir, bu da transkripsiyon adı verilen bir süreç yoluyla genlerin aktivasyonu ile sonuçlanır. JAK-STAT sinyallemesinin üç anahtar parçası vardır: Janus kinazlar (JAK'ler), sinyal dönüştürücü ve transkripsiyon proteinlerinin (STAT'ler) aktivatörü ve reseptörler (kimyasal sinyalleri bağlayan). Bozulmuş JAK-STAT sinyali, cilt rahatsızlıkları, kanserler ve bağışıklık sistemini etkileyen bozukluklar gibi çeşitli hastalıklara yol açabilir. JAK'ların ve STAT'lerin Yapısı Dört JAK proteini vardır: JAK1, JAK2, JAK3 ve TYK2.[1] JAK'lar bir FERM alanı (yaklaşık 400 kalıntı), SH2 ile ilgili bir alan (yaklaşık 100 kalıntı), bir kinaz alanı (yaklaşık 250 kalıntı) ve bir psödokinaz alanı (yaklaşık 300 kalıntı) içerir. Kinaz alanı, JAK...
Devamı