Kayıtlar

RNA etiketine sahip yayınlar gösteriliyor
Loading

MikroRNA (miRNA)

Resim
 Bir mikroRNA (kısaltılmış miRNA), bitkilerde, hayvanlarda ve bazı virüslerde bulunan, RNA susturma ve gen ekspresyonunun transkripsiyon sonrası düzenlenmesinde işlev gören küçük, tek iplikli, kodlamayan bir RNA molekülüdür (yaklaşık 22 nükleotit içerir). miRNA'lar, mRNA molekülleri içindeki tamamlayıcı dizilerle baz eşleşmesi yoluyla işlev görür. Sonuç olarak, bu mRNA molekülleri, aşağıdaki süreçlerin bir veya daha fazlası ile susturulur: (1) mRNA ipliğinin iki parçaya bölünmesi, (2) poli(A) kuyruğunun kısaltılması yoluyla mRNA'nın istikrarsızlaştırılması ve ( 3) mRNA'nın ribozomlar tarafından proteinlere daha az verimli çevirisi. miRNA'lar, RNA interferans (RNAi) yolunun küçük enterferans yapan RNA'larına (siRNA'lar) benzer, ancak miRNA'lar, kısa saç tokaları oluşturmak üzere kendi üzerlerine katlanan RNA transkript bölgelerinden türetilirken, siRNA'lar çift sarmallı RNA'nın daha uzun bölgelerinden türetilir. İnsan genomu 1900'den fazla miRNA&#

Yeni Araştırmalar, Memeli Hücrelerinin RNA Segmentlerini Tekrar DNA'ya Dönüştürebildiğini Gösterdi

Resim
 Thomas Jefferson Üniversitesi, Philadelphia, Güney Kaliforniya Üniversitesi, Beckman Araştırma Enstitüsü of the City of Hope ve New York Üniversitesi Tıp Fakültesi'nden bir araştırma ekibi, RNA dizilerinin tekrar DNA'ya yazılabileceğine dair ilk kanıtları sağladı. virüslerde ökaryotik hücrelerden daha yaygın olan bir başarı. Şekil 1: Bir DNA/RNA primer şablonu üzerinde Polθ'nin üçlü yapısı: (A) Polθ polimeraz; (B) Polθ ve PolθΔL tarafından DNA/RNA uzantısı; (C) Polθ:DNA/RNA:ddGTP'nin yapısı; (D) Polθ:DNA/RNA (deniz) ve Polθ:DNA/DNA (turuncu, 4x0q) süperpozisyonu; parmaklar ve başparmak alt alanları yeniden yapılandırmaya tabi tutulur; (E) Polθ:DNA/RNA (deniz) ve Polθ:DNA/DNA (turuncu, 4x0q) süperpozisyonu, K2181'in 12-Å kaymasını (mavi kutu; başparmak) ve E2246'nın 4.4-Å kaymasını (gri kutu; avuç içi); (F) Polθ:DNA/RNA:ddGTP ve Polθ:DNA/DNA:ddGTP yapılarından nükleik asitlerin ve ddGTP'nin süperpozisyonu; (G) üst: Polθ:DNA/RNA yapısındaki ddGTP ve 3' pr

Yıldırım Çarpmaları Erken Dünya'da Prebiyotik Fosfor Oluşturmada Rol Oynadı

Resim
 Fosfor, DNA, RNA, fosfolipidler ve adenosin trifosfat gibi biyomoleküllerde yer alan yaşam için anahtar elementlerden biridir. Meteorlarda erken Dünya'ya teslim edilen mineral schreibersite gibi fosfit mineralleri, ana prebiyotik fosfor kaynağı olarak savunulmaktadır. Gezegen bilimciler, bu minerallerin minimum miktarda milyarlarca yıldırım çarpmasıyla gezegenimize getirildiğine inanıyorlardı. Ancak şimdi, Leeds Üniversitesi ve Yale Üniversitesi'nden bir araştırma ekibi, bu temel işlevi yerine getirmede yıldırım çarpmalarının meteorlar kadar önemli olduğunu belirledi. Çalışmada, Yale Üniversitesi Ph.D. öğrenci Benjamin Hess ve meslektaşları, son derece büyük ve bozulmamış bir fulgurit örneğini incelediler. Örnek, 2016 yılında Amerika Birleşik Devletleri, Illinois, Glen Ellyn'de bir mülke yıldırım düştüğünde oluştu. Bilim adamları başlangıçta fulguritin nasıl oluştuğuyla ilgilendiler, ancak örneklerinde büyük miktarda schreibersit keşfetmeye hayran kaldılar. Erken Dünya'

RNA TİPLERİ

Resim
  RNA TİPLERİ mRNA (mesenger)= Proteinleri    kodlayan gruptur. DNA ’daki genetik bilginin proteine mesajı    çevirmesi için çekirdekten    sitoplazmaya     ribozom taşıyan moleküllerdir. DNA üzerindeki    üçlü nükleotit dizilimine    kod   adı verilir .  mRNA üzerindeki nükleotit dizilimine ise kodon adı verilir.Bu kodonlar aminoasitleri şifreler.     tRNA (transfer ) =  tRNA’nın kompleks bir yapısı vardır.  tRNA  mRNA      üzerinden    çevirilen    nükleotit    dizisine    antikodon    adı verilir. tRNA’nın    aminoasit    kolundan    bağlanan    aminoasitler    protein    oluşturmak    üzere    ribozomlara     transfer    edilir.     rRNA (ribozomal)= Kodlanmayan    RNA    moleküllerdir. Ribozomların    yapısını oluşturur.    Prokaryotlarda    30S    küçük alt birim ,50S büyük birim     vardır . Bu    birimler    protein sentezinde    birleşerek rRNA    tarafından ribozomu    oluştururlar.     snRNA (small nuclear)=    Protein sentezinde görev    almaz . mRNA’nın    splicing    tipi

TELOMERAZ YAPISI

Resim
 TELOMERAZ NEDİR ? Doğrusal kromozomların telomer muhafazası için telomeraz bazlı mekanizma çoğu ökaryotik hücre de korunmaktadır[ 1 , 2 ]. Telomerler, ökaryotik kromozomların uçlarını kaplayan protein/DNA kompleksleridir ve uzunluklarının korunması, genomik stabilite ve hücre canlılığı için gereklidir[ 3 ]. Telomer kısalması hücresel yaşlanma ile ilişkilidir ve kanser hücrelerinin çoğu, proliferatif ölümsüzlük kazanmak için telomerazın aktivasyonuna bağlıdır. Kök ve progenitör hücreler de düşük seviyelerde telomeraz eksprese etmektedir[ 4 ].  Telomer biyolojisinin öncüleri yarım asır önce ökaryotik kromozomların uçlarının çok önemli bir işlevi olduğunu ve telomer uzunluğunu korumak için özel bir mekanizma gerektiren bir son çoğaltma problemi olduğunu fark etmiş olsalarda, 1985' te Blackburn ve Greider tarafından [ 5 ] telomeraz enziminin moleküler karakterizasyonuna alan açan siliat Tetrahymena'dan elde edilen özütlerdeki telomeraz aktivitesi 1980'lerin sonlarında siliatla

mRNA COVID-19 AŞILARI

Resim
 AŞILARA YENİ BİR YAKLAŞIM mRNA aşıları, bulaşıcı hastalıklara karşı koruma sağlamaktadır. Vucüdun tepkisini veya hücrelerin tepkisini tetiklemek için birçok aşı vücudumuzda zayıflatılmış veya inaktivite edilmiş virüs, bakteri vs yerleştirilir. mRNA aşıları ise böyle değil. Bunun yerine, hücrelerimiz için vücudumuzda bir metabolizma tepkisini tetikleyen bir proteini- hatta sadece bir protein parçasını- nasıl yapacaklarını öğretirler. Antikor üretmek için vücud tepki verir ve bunun sonucunda virüs vücudumuza girdiğinden buna karşı antikor üreterek koruma sağlar.   COVID-19 mRNA AŞILARI NASIL ÇALIŞIR ? COVID-19 mRNA aşıları, hücrelerimize "başak proteini" ile  zararsız bir parça yapması için talimatlar verir. Başak proteini, COVID-19'a neden olan virüsün yüzeyinde bulunmaktadır. İlk olarak COVID-19 mRNA aşıları üst kol kasına verilir. Talimatlar (mRNA) bağışıklık hücrelerinin içine girdikten sonra, hücreler bunları protein parçasını yapmak için kullanır. Protein parçası yap

MUTASYON TAYİNİ

Resim
 MUTASYON TAYİNİ Birçok genetik hastalık bir gen ürünün modifikasyonu veya etkisizleştirilmesiyle sonuçlanan nokta mutasyonlarından kaynaklanabilir. Bu mutasyonlar tayin yöntemleri iki bakımdan önemlidir. Birincisi, bir genetik hastalıktan sorumlu bir gen ilk tanımlandığında, hastalığın durumunda sorumlu mutasyonu veya mutasyonları tanımlamak için bu genin  farklı bireylerdeki birçok versiyonun incelenmesi gereklidir. İkincisi, hastalığa neden olan bir mutasyon karakterize edildiğinde yüksek etkinlikte saptama yöntemlerine gerek olduğu için hekimler mutasyonu taşıyan ve hastalık geliştirme veya onu çocuklarına geçirme riski olan bireyleri tanımlamak için çok sayıdaki DNA örneğini tarayabilirler. Herhangi bir mutasyon DNA dizilenmesi ile tanımlanabilir, ancak dizileme nispeten yavaştır ve çok sayıdaki örneğin taranması için uygun olmayacaktır. DNA çip teknolojisi de uygulanabilmektedir. Ancak bu da henüz yaygın biçimde uygun  bir seçenek değildir. Bu nedenlerle  birçok düşük teknoloji y

Poliakrilamit Jel Elektroforezi (PAGE)

Resim
PAGE RNA numuneleri için güçlü bir araçtır.Poliakrilamit jel elektroforezi sonrası denatüre edildekten sonra RNA hakkında bilgi sağlamaktadır.  Poliakrilamit jel elektroforezi bir dizileme deneyinde ortaya çıkan sonlanmış zincir DNA molekül ailelerini incelemek için kullanılmaktadır. Agaroz jel elektroforezi sadece bir nükleotit boyu farklı tek iplikli DNA moleküllerini ayırmak için ihtiyaç duyulan ayrıştırma gücüne sahip olmadığından bu amaçla kullanılamaz. Poliakrilamit jeller agaroz jellerden daha küçük por büyüklüğüne sahiptir ve 10 ila 1500 bç arası moleküllerin hassas ölçüde DNA ayrımları gerektiren, örneğin sadece iki veya üç baz çiftiyle büyüklüğü değişebilen farklı alel ürünleri olan mikrosatellit lokuslarına yönelik PCR' larda amplifikasyon ürünlerinin incelenmesinde de kullanılmaktadır. Poliakrilamit jeller aralayıcılarla ayrı tutulan iki cam levha arasında tabakalar veya kapiler elektroforez için uygun uzun ince kolonlar şekilde hazırlanabilmektedir.                   

RNA ÇALIŞMAK İÇİN TEKNİKLER

Resim
 DNA moleküllerini çalışmak içintasarlanan tekniklerin bir çoğu RNA ile kullanmak için uyarlanabilmektedir. RNA' nın agaroz jel elektroforezi her bir molekülün göç hızının tamamıyla uzunluğuna bağlı olması için RNA' nın denatürasyonundan sonra yapılır ve pek çok RNA' da oluşan molekül içi baz eşleşmelerinden etkilenmez. Denatüre edici genellikle formaldehit veya glioksal jele yüklenmeden önce örneğe eklenmektedir.  Northern Hibritleme Bir RNA jelinin naylon bir membrana blotladığı ve işaretli bir pprobla hibritlendiği işlem ifade eder. Bu Southern hibritlemeyle aynıdır ve benzer bir yolla yapılır.  İşaretli RNA Molekülleri   Genellikle işaretli bir ribonükleotit varlığında bir DNA kalıbının RNA' ya kopyalanmasıyla hazırlanmaktadır. SP6, T3 veya T7 bakteriyofajlarının RNA polimeraz enzimleri kullanılır, çünkü bunlar 30 dakika 1mikrogram DNA'dan 30 mikrogram işaretli olarak üretilmektedir.  RNA' nın ayrıca saflaştırılmış poli(A) polimeraz muamelesiyle de ucu işare
ΔΔCt Hesaplama

ΔΔCt Hesaplama











ΔΔCt Sonucu: